El Ing. Vidal Quirós fungió como primer rector en el periodo de 1971 a 1982, en el cual fue precedido por el arquitecto Roberto Villalobos Ardón, quien fue el primero en ser elegido democráticamente entre 1983 y 1987.
Durante el periodo 1987 – 1995, el máster Arturo Jofre Vartanian fungió en este puesto; luego continuó el Ing. Alejandro Cruz Molina desde 1995 hasta el 2003, fecha en la cual el Máster Eugenio Trejos Benavides asumió la rectoría de la institución, hasta junio del 2011, comenzando sus labores el Dr. Julio Calvo Alvarado.
El Dr. Calvo se mantuvo como rector hasta el 2019; año a partir del cual, asumió el Ing. Luis Paulino Méndez Badilla hasta el 2022.
